Analyse bioinformatique2026
Pipeline Reproductible pour l'Analyse du Microbiome Édaphique en Environnements Miniers
GenoLabGab Blog
Lire l'article
Disponible pour une collaboration
Keny Karl Mounguele
Ingénieur biotechnologue et bioinformaticien
Fondateur de GenoLabGab - pipelines NGS automatisés, criblage virtuel de composés bioactifs et conception de vaccins par vaccinomique inverse.
karl@genolab: ~/pipeline
➜ ~ ▊
Découvrir
◆ BWA-MEM◆ GATK◆ SnpEff◆ Snakemake◆ AlphaFold2◆ AutoDock Vina◆ PyMOL◆ ChimeraX◆ NetMHCpan◆ IEDB◆ FastQC◆ MultiQC◆ BWA-MEM◆ GATK◆ SnpEff◆ Snakemake◆ AlphaFold2◆ AutoDock Vina◆ PyMOL◆ ChimeraX◆ NetMHCpan◆ IEDB◆ FastQC◆ MultiQC
🔬
2+
Années de recherche
🧬
4
Projets actifs
🛠️
6
Catégories d'outils
📄
3
Publications
Ce que je fais
Domaines d'expertise
Trois piliers de ma pratique en bioinformatique computationnelle, de la génomique à la vaccinomique.
Génomique computationnelle
Pipelines NGS automatisés pour le contrôle qualité, l'alignement, la détection de variants et l'annotation fonctionnelle. Expertise avec BWA-MEM, GATK, SnpEff et les workflows Snakemake.
BWA-MEMGATKSnpEffSnakemake
Bioinformatique structurale
Criblage virtuel de composés bioactifs contre des cibles thérapeutiques. Modélisation 3D avec AlphaFold2 et ColabFold, docking moléculaire et visualisation avec PyMOL et ChimeraX.
AutoDock VinaAlphaFold2PyMOLChimeraX
Vaccinomique
Conception de candidats vaccins par vaccinomique inverse. Prédiction d'épitopes B et T cellulaire avec NetMHCpan et IEDB, modélisation structurale et validation par docking immunitaire.
NetMHCpanIEDBPfs48/45TBV
Pipeline
Contrôle Qualité NGS
Aperçu interactif des outils d'évaluation de la qualité des données brutes de séquençage générés par nos pipelines bioinformatiques. Les scores Phred garantissent la fiabilité de chaque analyse.
Qualité excellente (Q ≥ 30)
Qualité acceptable (Q ≥ 20)
Chargement du module de contrôle qualité...
Publications
Articles récents
Analyse bioinformatique2026
Qu'est-ce que la bioinformatique ?
GenoLabGab Blog
Une introduction claire et rigoureuse à la bioinformatique, ses fondements, ses méthodes et ses applications concrètes en santé, agriculture et environnement.
Lire l'articleAnalyse bioinformatique2026
Identification de Mycobacterium tuberculosis et résistance aux antituberculeux par séquençage Nanopore ciblé
GenoLabGab Blog
Réanalyse bioinformatique de 277 échantillons cliniques de sputum (BioProject PRJNA1177198, NIRT Chennai, Inde) via TB-Profiler v6.7.0 et le catalogue OMS v2+. 46,6% de résistance à au moins une drogue, 21,7% de Pre-XDR-TB, et concordance méthodologique complète avec Tang et al. (2024, Front. Microbiol.) sur les mutations canoniques de résistance.
Lire l'articleIntéressé par une collaboration ?Projet de recherche · Stage · Discussion scientifiqueIntéressé par une collaboration ?Projet de recherche · Stage · Discussion scientifiqueIntéressé par une collaboration ?Projet de recherche · Stage · Discussion scientifique