Analyse bioinformatique2026
Pipeline Reproductible pour l'Analyse du Microbiome Édaphique en Environnements Miniers
GenoLabGab Blog
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Bonjour, je suis
Keny Karl
Mounguele
Ingénieur Bioinformaticien
Diplômé de l'Université Euromed de Fès · Fès, Maroc
Fondateur de GenoLabGab, une initiative indépendante en biologie computationnelle. Je développe des pipelines automatisés pour l'analyse NGS, le criblage virtuel de composés bioactifs, et la conception de vaccins par vaccinomique.
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Ce que je fais
Domaines d'expertise
Trois piliers de ma pratique en bioinformatique computationnelle, de la génomique à la vaccinomique.
Génomique computationnelle
Pipelines NGS automatisés pour le contrôle qualité, l'alignement, la détection de variants et l'annotation fonctionnelle. Expertise avec BWA-MEM, GATK, SnpEff et les workflows Snakemake.
BWA-MEMGATKSnpEffSnakemake
Bioinformatique structurale
Criblage virtuel de composés bioactifs contre des cibles thérapeutiques. Modélisation 3D avec AlphaFold2 et ColabFold, docking moléculaire et visualisation avec PyMOL et ChimeraX.
AutoDock VinaAlphaFold2PyMOLChimeraX
Vaccinomique
Conception de candidats vaccins par vaccinomique inverse. Prédiction d'épitopes B et T cellulaire avec NetMHCpan et IEDB, modélisation structurale et validation par docking immunitaire.
NetMHCpanIEDBPfs48/45TBV
Pipeline
Contrôle Qualité NGS
Aperçu interactif des outils d'évaluation de la qualité des données brutes de séquençage générés par nos pipelines bioinformatiques. Les scores Phred garantissent la fiabilité de chaque analyse.
Qualité excellente (Q ≥ 30)
Qualité acceptable (Q ≥ 20)
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Publications
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