Blog
Analyses bioinformatiques, pipelines et notes de recherche
2026-09-27
Pipeline Reproductible pour l'Analyse du Microbiome Édaphique en Environnements Miniers
2026-08-04
Qu'est-ce que la bioinformatique ?
Une introduction claire et rigoureuse à la bioinformatique, ses fondements, ses méthodes et ses applications concrètes en santé, agriculture et environnement.
2026-07-02
Identification de Mycobacterium tuberculosis et résistance aux antituberculeux par séquençage Nanopore ciblé
Réanalyse bioinformatique de 277 échantillons cliniques de sputum (BioProject PRJNA1177198, NIRT Chennai, Inde) via TB-Profiler v6.7.0 et le catalogue OMS v2+. 46,6% de résistance à au moins une drogue, 21,7% de Pre-XDR-TB, et concordance méthodologique complète avec Tang et al. (2024, Front. Microbiol.) sur les mutations canoniques de résistance.
2026-05-25
Résistance antipaludéenne chez P. falciparum en Éthiopie
Analyse bioinformatique complète de 318 isolats cliniques de P. falciparum issus de sites de résurgence en Éthiopie (BioProject PRJNA1465284). Détection de 7 mutations de résistance validées par l'OMS, dont kelch13-P441L à 4,1% — signal d'alerte précoce pour la résistance à l'artémisinine en Afrique de l'Est.
2024-11-15
Criblage virtuel contre la protéine p24 du VIH-1
Pipeline complet de docking moléculaire sur la protéine de capside p24 du VIH-1 (PDB : 4XFX) — préparation des ligands, définition de la grille et scoring AutoDock Vina v1.2.5. Meilleur hit : CNP0013909.3 à −8.99 kcal/mol.